За час свого існування ІЄІ налагодив наукові зв’язки з низкою закордонних інституцій, що працюють над суміжною науковою проблематикою, а саме:
- Генеральним консульством Республіки Польща у Львові;
- Почесним консульством та Центром студій європейської інтеграції Литовської республіки у Львові;
- Європейським центром і кафедрою менеджменту Варшавського університету;
- Інститутом міжнародних відносин, міжнародного права та європейського права Іннсбрукського університету імені Франца Леопольда, Австрія;
- Інститутом Молдови Лейпцігського університету;
- Гельсінським університетом;
- Інстутутом конституційного, адміністративного права та порівняльного правознавства Грацького університету імені Карла Франца, Австрія;
- Інститутом міжнародних відносин Торунського університету;
- Європейським інститутом у Лодзі, Польща;
- Інститутом європеїстики Ягелонського університету, Краків, Польща;
- Кафедрою європеїстики імені Жана Монне Щецінського університету, Польща;
- Вищою школою міжнародних студій, Лодзь, Польща;
- Українсько-австрійським бюро співпраці в освіті, науці та культурі, Львів, Україна;
- Фундацією імені Роберта Шумана, Варшава, Польща;
- Краківською вищою школою імені Анджея Фрича Моджевського;
- Вищою школою управління в Бєльско-Бялій;
- Вищою школою управління в Жешові;
- Британською Радою в Україні;
- Польським інститутом у Києві;
- Агенцією регіонального розвитку й європейської інтеграції та іншими.